Estatística aplicada à ecologia usando o R

Tópicos em Biologia Animal — UNESP/IBILCE, São José do Rio Preto (2011)

Disciplina de pós-graduação de duas semanas em Biologia Animal na UNESP/IBILCE (São José do Rio Preto), oferecida em 2011 em conjunto com Thiago Gonçalves-Souza e Fernando R. da Silva. Esta página reúne os slides das aulas ministradas por mim, além da apostila, dos scripts e dos dados dos exercícios.

Sobre a disciplina

O curso cobriu modelos lineares generalizados, os principais métodos multivariados e outras ferramentas de análise em ecologia, usando o R como plataforma. Foi a origem da apostila Estatística aplicada à ecologia usando o R, hospedada pelo CRAN e usada desde então em várias disciplinas de pós-graduação no Brasil.

Os materiais abaixo são de 2011 e estão preservados como registro histórico. Muita coisa na prática de análise em R mudou desde então — para o material atualizado, veja o livro Análises Ecológicas no R e a disciplina Introdução à Linguagem R.

Apostila

Apostila no CRAN (PDF, 6,7 MB)

Provete, D.B.; Silva, F.R.; Gonçalves-Souza, T. (2011). Estatística aplicada à ecologia usando o R. Universidade Estadual Paulista, São José do Rio Preto. Contribuição documental do CRAN.

Slides

Aulas ministradas por mim

Parte 1 — Introdução ao R Primeiro contato com a linguagem: objetos, importação de dados e as funções básicas de inspeção.

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Parte 2 — Estatística básica Do ciclo dados–análise–teoria–modelo aos testes elementares.

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Parte 3 — Gráficos Construção de gráficos no R base para exploração e publicação.

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Parte 4 — Métodos multivariados Agrupamento, ordenação e análises de gradiente aplicadas a dados de comunidades.

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Aulas ministradas pelos co-autores

Reproduzidas aqui com autorização de Thiago Gonçalves-Souza e Fernando R. da Silva. Os arquivos originais estavam em .pptx; foram convertidos para PDF sem alteração de conteúdo.

Introdução ao R — Thiago Gonçalves-Souza

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Distribuições estatísticas — Fernando R. da Silva

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Modelos lineares generalizados — Fernando R. da Silva

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Análises canônicas — RDA, CCA, Mantel e Procrustes — Thiago Gonçalves-Souza

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Scripts e dados

Script completo da apostila (.R)   Scripts por aula (.zip)   Dados dos exercícios (.zip)

O arquivo de dados reúne os 49 conjuntos usados ao longo da apostila e das aulas práticas.


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