Aula 08 — Introdução à análise multivariada de dados
Introdução à análise multivariada aplicada a dados de comunidades de ambientes lênticos. Objetivos principais (direção de variação, correlação de matrizes, diferenças entre grupos); índices de dissimilaridade (Jaccard, Sørensen, Bray–Curtis, Morisita-Horn, Gower, Euclidiana, Manhattan, Canberra); análises exploratórias vs testes de hipótese.
Classificação — análise de cluster hierárquica (UPGMA, Ward), coeficiente de correlação cofenética, validação por bootstrap multiescala (pvclust), análise de espécie indicadora (IndVal; Dufrêne & Legendre 1997). Ordenação irrestrita — PCA, PCoA, nMDS. Ordenação restrita — CCA (gradientes longos, modelo unimodal) e RDA (gradientes curtos, modelo linear).
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Leituras recomendadas
- James, F.C. & McCulloch, C.E. 1990. Multivariate analysis in ecology and systematics: panacea or Pandora’s box? Annual Review of Ecology and Systematics 21:129–166.
- Legendre, P. & Legendre, L.F.J. 2012. Numerical Ecology. 3ª ed. Elsevier.
- Valentin, J.L. 2012. Ecologia Numérica. 2ª ed. Interciência.
- Legendre, P. & De Cáceres, M. 2013. Beta diversity as the variance of community data: dissimilarity coefficients and partitioning. Ecology Letters 16:951–963.
- Dufrêne, M. & Legendre, P. 1997. Species assemblages and indicator species: the need for a flexible asymmetrical approach. Ecological Monographs 67:345–366.
- De Cáceres, M. & Legendre, P. 2009. Associations between species and groups of sites: indices and statistical inference. Ecology 90:3566–3574.
- Shimodaira, H. 2004. Approximately unbiased tests of regions using multistep-multiscale bootstrap resampling. Annals of Statistics 32:2616–2641.
- Ramette, A. 2007. Multivariate analyses in microbial ecology. FEMS Microbiology Ecology 62:142–160.
Para aprofundar nos métodos multivariados, veja o curso de Análises Multidimensionais (PPG em Biologia Animal).
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