Aula 01 — Introdução e desenho de estudos comparativos
Por que precisamos de métodos comparativos? Como o sinal de descendência comum confunde regressões em dados de espécies. Introdução ao R aplicado à filogenia (objetos
phylo, leitura de árvores em Newick e Nexus).
Por que precisamos de métodos comparativos? Como o sinal de descendência comum confunde regressões em dados de espécies. Introdução ao R aplicado à filogenia (objetos phylo, leitura de árvores em Newick e Nexus).
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Código R (aula prática)
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Walkthrough completo da aula prática — R básico, importação de filogenias, manipulação
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Dados utilizados
Leituras recomendadas
- Pennell, M.W. & Harmon, L.J. 2013. An integrative view of phylogenetic comparative methods: connections to population genetics, community ecology, and paleobiology. Annals NY Acad Sci.
- Rezende, E.L. & Diniz-Filho, J.A.F. 2012. Phylogenetic analyses: comparing species to infer adaptations and physiological mechanisms. Comp Physiol.
- Garland, T. et al. Phylogenetic approaches in comparative physiology.
Recursos externos
- AnthroTree (Charles Nunn)
- Companion site — Modern Phylogenetic Comparative Methods
- Workshop Ilhabela 2015 — material online
- Treethinkers
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