Metadados — anuros_altitude.csv

Conjunto de dados da disciplina

Conjunto de dados usado como fio condutor da disciplina Introdução à Linguagem R (PPGEC/UFMS). São dados reais, publicados.

Fonte

Bovo, R.P.; Simon, M.N.; Provete, D.B.; Lyra, M.; Navas, C.A.; Andrade, D.V. (2023). Beyond Janzen’s Hypothesis: How Amphibians That Climb Tropical Mountains Respond to Climate Variation. Integrative Organismal Biology 5(1): obad009. https://doi.org/10.1093/iob/obad009

Arquivo original: RPB_data_alt.csv, do material suplementar do artigo. Renomeado aqui apenas para seguir as regras de nomenclatura da aula 02. O conteúdo não foi alterado.

Desenho amostral

225 indivíduos de 5 espécies de anuros, amostrados em 6 altitudes distribuídas em 2 serras da Mata Atlântica (SP/RJ/MG).

Altitude (m) Serra
35 Serra do Mar
820 Serra do Mar
1022 Serra do Mar
1500 Serra do Mar
550 Serra da Mantiqueira
1600 Serra da Mantiqueira

Atenção: altitude e serra estão perfeitamente confundidas — cada altitude ocorre em uma única serra. Não é possível estimar os dois efeitos separadamente no mesmo modelo. Por isso o artigo trata as serras em separado. Este é o assunto da aula 06.

Variáveis

Coluna O que é Unidade
ID identificador do indivíduo —
Species espécie —
Sex sexo (Male/Female) —
EWL_Ugcm2s1 taxa de perda evaporativa de água (Evaporative Water Loss) µg H₂O·cm⁻²·s⁻¹
WU_Ugcm2s1 taxa de reidratação (Water Uptake) µg H₂O·cm⁻²·s⁻¹
perc_hidration_after_EWL % da massa corpórea inicial ao fim do ensaio de EWL %
Bodymass_g massa corpórea g
CTmin tolerância térmica mínima (Critical Thermal Minimum) °C
CTmax tolerância térmica máxima (Critical Thermal Maximum) °C
Tbr amplitude térmica — derivada: CTmax - CTmin °C
WT tolerância ao aquecimento — derivada: CTmax - BIO_5 °C
Mountain_Range serra —
Altitude_m altitude do sítio m
Altitude_categorical rótulo do sítio (terras baixas / altas + serra) —
Lat, Lon coordenadas do sítio graus decimais
BIO_1 temperatura média anual °C
BIO_2 amplitude diurna média °C
BIO_5 temperatura máxima do mês mais quente °C
BIO_6 temperatura mínima do mês mais frio °C
BIO_7 amplitude térmica anual °C
BIO_12 precipitação anual mm
BIO_13 precipitação do mês mais chuvoso mm
BIO_14 precipitação do mês mais seco mm
PET_min_mes_seco evapotranspiração potencial, mês seco mm
PET_max_mes_umido evapotranspiração potencial, mês úmido mm

As variáveis BIO_* vêm do WorldClim e são do sítio, não do indivíduo: repetem-se em todas as linhas da mesma altitude.

Como CTmin e CTmax foram medidos

Rampa de aquecimento/resfriamento de 0,1 °C/min em câmara climatizada. Registra-se a temperatura corpórea (cloacal) no momento da perda do reflexo de endireitamento. Detalhes no Material Suplementar 2 do artigo.

Dados faltantes

NA em Sex (107 de 225), CTmax, Tbr e WT (35), perc_hidration_after_EWL (31), WU_Ugcm2s1 (22) e EWL_Ugcm2s1 (11). São ausências reais — animais que não se recuperaram do ensaio, ou medidas não realizadas.

Duas coisas para reparar no arquivo

  1. As quebras de linha são CRLF (padrão Windows). O R lê sem reclamar, mas alguns programas mostram o arquivo como uma linha só.
  2. Tbr e WT são colunas derivadas guardadas junto com as originais. Isso viola a regra de “cada variável numa coluna, cada célula um valor”? Não — mas guardar o que o script pode recalcular é uma escolha, e vale discutir na aula 02.